Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HBBP68871 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HBBP68871 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms