Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms