Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EMP1P54849 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EMP1P54849 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EMP1P54849 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EMP1P54849 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EMP1P54849 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EMP1P54849 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms