Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD4P46934 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms