Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANGAP1P46060 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms