Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL1P40616 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms