Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGAEP38570 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGAEP38570 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms