Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EPHA3P29320 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHA3P29320 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHA3P29320 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms