Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms