Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA6P23229 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms