Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR3P22607 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms