Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DPA1P20036 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms