Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms