Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms