Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFTRP13569 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFTRP13569 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFTRP13569 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFTRP13569 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFTRP13569 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms