Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXD8P13378 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms