Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms