Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4BP0C0L5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C4BP0C0L5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms