Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJB1P08034 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJB1P08034 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms