Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVV-1B6SEH8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms