Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LINC00587B1AMM8 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00587B1AMM8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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