Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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