Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms