Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP35Q9P2H5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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