Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ZNRD1Q9P1U0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms