Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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