Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ABCC13Q9NSE7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms