Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms