Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1927.8 ms