Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms