Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 400.5 ms