Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPATA16Q9BXB7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms