Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms