Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FYCO1Q9BQS8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms