Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT140Q96RY7 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms