Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNC2Q96PR1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNC2Q96PR1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms