Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms