Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms