Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms