Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DCAF4Q8WV16 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms