Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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TTC29Q8NA56 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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TTC29Q8NA56 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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TTC29Q8NA56 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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TTC29Q8NA56 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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TTC29Q8NA56 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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TTC29Q8NA56 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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TTC29Q8NA56 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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TTC29Q8NA56 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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TTC29Q8NA56 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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TTC29Q8NA56 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTC29Q8NA56 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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