Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms