Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms