Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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