Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAGSQ8N159 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms