Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRP13Q86W25 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms