Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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