Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MICAL3Q7RTP6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms