Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DUX4L9Q6RFH8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms