Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms